More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6180 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 360 aa  727    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  98.06 
 
 		 360 aa  715    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  80.83 
 
 		 365 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3265  CpsI  66.94 
 
 		 360 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3214  glycosyl transferase, group 1 family protein  66.39 
 
 		 387 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  64.82 
 
 		 381 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3252  glycosyl transferase, group 1 family protein  66.39 
 
 		 361 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  57.73 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  40.72 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  39.34 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  38.5 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1347  glycosyl transferase, group 1  36.43 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.407734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1311  glycosyl transferase, group 1  37.11 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1328  glycosyl transferase, group 1  37.11 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05199  glycosyltransferase  32.93 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001318  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsI glycosyltransferase  35.54 
 
 		 343 aa  133  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0953  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 		 355 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517229  normal  0.256855 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0028  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 344 aa  98.6  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.038323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 		 358 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 704 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 367 aa  89.7  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  28.07 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.32 
 
 		 356 aa  86.7  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  20.44 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  20.44 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  30.27 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  22.84 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  24.29 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  24.58 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  23.35 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  32.52 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  20.22 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 		 461 aa  69.7  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  23.41 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  21.85 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  22.63 
 
 		 394 aa  67  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0741  glycosyltransferase-like protein  26.42 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.45783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  29.3 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  38.74 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  29.48 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  37.09 
 
 		 750 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  29.82 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  17.68 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  21.82 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  28.52 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  37.2 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  30.13 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>