More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2183 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
424 aa  859    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  93.38 
 
 
423 aa  798    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  93.38 
 
 
423 aa  797    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  75.68 
 
 
421 aa  596  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  62.3 
 
 
424 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  63.77 
 
 
422 aa  481  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  40.38 
 
 
422 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  42.78 
 
 
434 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  42.29 
 
 
434 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1719  glycosyl transferase group 1  40.61 
 
 
421 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  41.75 
 
 
443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  39.17 
 
 
420 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2590  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
410 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3130  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 
448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6753  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
414 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
431 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3402  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
448 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  31.22 
 
 
384 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  29.39 
 
 
401 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
392 aa  123  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
415 aa  122  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
404 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
401 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
403 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
391 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
394 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
414 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
426 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
393 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
410 aa  99.8  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
403 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
390 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
409 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  25.12 
 
 
401 aa  86.7  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
374 aa  86.7  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0807  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.21 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.64262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0643  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.21 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  22.51 
 
 
778 aa  80.9  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0628  glycosyltransferase  30.09 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0028  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.61 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
539 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2498  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.61 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2876  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.61 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2208  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.61 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274165  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6490  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632954  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1125  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
426 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  40.13 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
409 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  36.42 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0521  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.71 
 
 
398 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  24.46 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
733 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0654  glycosyltransferase  23.43 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.385446  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  26.48 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0539  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  37.82 
 
 
803 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  37.25 
 
 
812 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
447 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  32.28 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
425 aa  69.7  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
904 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  24.21 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3317  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4167  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4199  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02227  hypothetical protein  36.64 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  24.81 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
816 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  41.88 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  35.5 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>