241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001318 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001318  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsI glycosyltransferase  100 
 
 		 343 aa  714    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18845  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05199  glycosyltransferase  76.9 
 
 		 343 aa  564  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1311  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 		 353 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1328  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 		 353 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1347  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 		 353 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.407734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3265  CpsI  35.47 
 
 		 360 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  35.47 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3214  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.89 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3252  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.17 
 
 		 361 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 		 365 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 		 360 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 360 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0953  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517229  normal  0.256855 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0028  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.038323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 393 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  23 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  26.25 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  26.55 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2905  hypothetical protein  27.51 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  22.59 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 379 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.99 
 
 		 964 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.71 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  27.2 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  26.17 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 468 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  26.43 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  25.39 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1802  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3142  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal  0.711865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  25.67 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.43 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.67 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.05 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0201  a-glycosyltransferase  21.22 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  26.09 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0056  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.368795 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.53 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 385 aa  53.5  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 394 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0316  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 		 424 aa  53.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.451798  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 400 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 389 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 		 383 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4097  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 		 376 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.627291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 384 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  21.07 
 
 		 344 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 		 373 aa  53.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  22.27 
 
 		 367 aa  52.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13720  glycosyltransferase  29.2 
 
 		 351 aa  52.8  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  33.08 
 
 		 442 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5390  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.81 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839931  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 		 429 aa  52  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1997  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0854  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0579816 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4919  group 1 glycosyl transferase  24.73 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.568144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  22.06 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>