250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1802 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1802  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
371 aa  773    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0456  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
373 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0645545  hitchhiker  0.00671618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3569  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
765 aa  69.3  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1459  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
346 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00514335  hitchhiker  0.00279802 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  21.07 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
763 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
424 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2749  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
393 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000830011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2954  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
376 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  25.52 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3362  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
393 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1575  glycosyltransferase  24.83 
 
 
507 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 
379 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001318  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsI glycosyltransferase  27.41 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18845  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
393 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0109  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.69 
 
 
402 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84899  normal  0.0173656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
368 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
408 aa  56.6  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
396 aa  56.6  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0498  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.44 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0148248  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 
394 aa  56.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
359 aa  56.2  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  25.79 
 
 
382 aa  56.2  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4333  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4278  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4473  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0305  putative glycosyl transferase  26.34 
 
 
329 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.4 
 
 
407 aa  53.9  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
380 aa  53.5  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
658 aa  53.1  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  21.97 
 
 
367 aa  52.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2710  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 
367 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.395873  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
421 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
402 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  21.55 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1997  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
383 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003534  glycosyltransferase  27.72 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4681  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.07 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  28.89 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3985  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0595818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
427 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0126  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
699 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
411 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
343 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  28.48 
 
 
420 aa  50.8  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
387 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0953  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
355 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517229  normal  0.256855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  27.56 
 
 
373 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
418 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
426 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
348 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
394 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 
325 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 
325 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
398 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
351 aa  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.53 
 
 
404 aa  49.7  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  24.16 
 
 
393 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 
365 aa  49.7  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
379 aa  49.3  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  26.46 
 
 
427 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
504 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  26.98 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.68 
 
 
857 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
371 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3127  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.020191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4365  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
422 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.893788 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  20.99 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
398 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  20.29 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
381 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>