More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0456 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0456  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
373 aa  785    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0645545  hitchhiker  0.00671618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1802  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
371 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3569  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4333  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4278  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
385 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4473  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4681  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.85 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0498  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.17 
 
 
380 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0148248  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3985  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0595818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1459  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00514335  hitchhiker  0.00279802 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  28.72 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  22.41 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1997  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
383 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0109  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.77 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84899  normal  0.0173656 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
399 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
669 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
380 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
387 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37583  predicted protein  25.74 
 
 
400 aa  62.8  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17568  hitchhiker  0.00128126 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.63 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.87 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 
398 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  21.39 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.24 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  22.19 
 
 
388 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
377 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  20.44 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  21.3 
 
 
371 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 
348 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
397 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
353 aa  60.1  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
367 aa  59.7  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  28.14 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0369  mannosyltransferase  23.73 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
363 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  36.7 
 
 
439 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
389 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
366 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  29.01 
 
 
397 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1397  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
368 aa  58.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  29.52 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  36.54 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  33.88 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
383 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
359 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
383 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  24.18 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1131  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 
411 aa  57.4  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2444  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
345 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  26.18 
 
 
480 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  23.58 
 
 
372 aa  57  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0854  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
404 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0579816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
371 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0044  glycosyltransferase  24.43 
 
 
353 aa  57  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  21.04 
 
 
387 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
411 aa  56.6  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1055  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
372 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 
351 aa  56.6  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
678 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  23.5 
 
 
397 aa  56.2  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  32.08 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 
394 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  27.54 
 
 
365 aa  55.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0387  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  21.47 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.270074  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  22.69 
 
 
413 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2978  glycosyltransferase-like protein  27.12 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
381 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  20.07 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
439 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
390 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0016  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 
380 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0290375  normal  0.0192422 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  21.7 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>