More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2444 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2444  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
345 aa  707    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
339 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0315  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
339 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0333  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
339 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.279236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
343 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2914  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.38 
 
 
249 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
463 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.41 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  34.13 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.57 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 
398 aa  77  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  22.25 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  27.49 
 
 
503 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
379 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  29.19 
 
 
486 aa  67.4  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
390 aa  67  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
384 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  23.55 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  23.36 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.51 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
468 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
424 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
434 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.33 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.33 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.33 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.33 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.33 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.33 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  29.26 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 
390 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.18 
 
 
378 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
403 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.33 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
812 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
378 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
378 aa  63.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
370 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
378 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
375 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
378 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  21.47 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
765 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 
414 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
378 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
378 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 
457 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
378 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  28.25 
 
 
430 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3222  glycosyl transferase, group 1  22.04 
 
 
365 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.25 
 
 
427 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
383 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  24.15 
 
 
819 aa  61.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
376 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1156  glycosyl transferase, group 1  21.54 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.656531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
390 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  22.12 
 
 
411 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0352  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
322 aa  60.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.27 
 
 
396 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
381 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  22.75 
 
 
409 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
377 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.06 
 
 
388 aa  60.1  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 
359 aa  60.1  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
378 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
380 aa  59.7  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>