More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0901 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  767    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 
379 aa  273  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  38.51 
 
 
348 aa  249  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
357 aa  212  9e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
359 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
396 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
390 aa  120  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
369 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
377 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
393 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
390 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
390 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
391 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
426 aa  107  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
414 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  25.7 
 
 
392 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 
413 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
457 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
413 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
372 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
904 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
422 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 
398 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
396 aa  103  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
387 aa  103  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
452 aa  103  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
391 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
391 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
391 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
374 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
408 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 
398 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
385 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  22.68 
 
 
370 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  24.73 
 
 
360 aa  99.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.02 
 
 
423 aa  99.4  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
399 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
361 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
409 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  24.63 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  26.56 
 
 
364 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25 
 
 
401 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
409 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 
446 aa  97.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  24.27 
 
 
397 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
398 aa  97.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
374 aa  97.4  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
376 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 
410 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
434 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  22.44 
 
 
415 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  22.95 
 
 
413 aa  96.7  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
391 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  21.5 
 
 
363 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
464 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  23.23 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  29.33 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  23.69 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  21.61 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 
370 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
487 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  21.63 
 
 
417 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
407 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
468 aa  94  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
385 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 
476 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 
425 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 
410 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  23.94 
 
 
404 aa  93.6  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
435 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
406 aa  92.8  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 
355 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  22.71 
 
 
429 aa  92.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
416 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  22.39 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.4 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.99 
 
 
378 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  23.93 
 
 
407 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  22.65 
 
 
504 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 
397 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  23.16 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>