More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1131 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1131  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 411 aa  825    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3362  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 393 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2749  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 393 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2957  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1120  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 386 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.67 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.97 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  31.16 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.14 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2329  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0153585 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  21.77 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  23.71 
 
 		 537 aa  87  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.11 
 
 		 404 aa  87  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 396 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 385 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 		 389 aa  86.7  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5045  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 415 aa  86.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 		 748 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  22.65 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  27.15 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 		 536 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  29.95 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  29.05 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  25.72 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  33.16 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  31.12 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  34.23 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  24.91 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.34 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.58 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  25.89 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  25.17 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  27.87 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 672 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  29.13 
 
 		 803 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 377 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  24.08 
 
 		 935 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>