More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3472 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
427 aa  845    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1488  glycosyl transferase group 1  82.63 
 
 
427 aa  674    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0380983  normal  0.669661 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1760  glycosyl transferase group 1  49.76 
 
 
428 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  51.17 
 
 
439 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.39 
 
 
401 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
390 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
424 aa  87.8  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
413 aa  87.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
392 aa  86.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
414 aa  86.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  25.8 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24.53 
 
 
376 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
417 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
378 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5426  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  26.57 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2754  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  29.41 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3682  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558213  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
381 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
380 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  23.09 
 
 
406 aa  79  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  27.99 
 
 
404 aa  79  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
403 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.03 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  25.89 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  26.48 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  27.8 
 
 
404 aa  77  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
446 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.51 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
536 aa  76.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2078  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
353 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
447 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  29.41 
 
 
398 aa  76.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.82 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  29.34 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
871 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8126  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.61 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  27 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.45 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.39 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.23 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.69 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  31.13 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.52 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  26.52 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2855  group 1 glycosyl transferase  28.73 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.28 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  24.54 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>