More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3111 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  100 
 
 		 420 aa  864    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2348  glycosyl transferase, group 1  66.67 
 
 		 411 aa  568  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0363579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1740  glycosyl transferase group 1  64.88 
 
 		 411 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2083  glycosyl transferase, group 1  64.88 
 
 		 411 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0297  glycosyl transferase group 1  57.14 
 
 		 411 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0129  glycosyl transferase, group 1  49 
 
 		 397 aa  398  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.730138  hitchhiker  0.000955625 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0594  glycosyl transferase, group 1  49.5 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1359  glycosyl transferase, group 1  52.15 
 
 		 402 aa  396  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.254886 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0419  glycosyl transferase group 1  46.35 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.102155  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0797  glycosyl transferase, group 1  46.87 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1812  glycosyl transferase, group 1  46 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0100815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2023  glycosyl transferase, group 1  45.36 
 
 		 442 aa  350  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  43.15 
 
 		 410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  41.71 
 
 		 419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1718  glycosyl transferase group 1  41.4 
 
 		 433 aa  316  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5908  glycosyl transferase group 1  40.8 
 
 		 410 aa  312  7.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3082  glycosyl transferase, group 1  42.54 
 
 		 474 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2973  glycosyl transferase, group 1  43.1 
 
 		 416 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0542  glycosyl transferase group 1  40.25 
 
 		 406 aa  301  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000128948  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  40.25 
 
 		 406 aa  300  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3832  glycosyl transferase group 1  40.58 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0427  glycosyl transferase group 1  41.35 
 
 		 460 aa  296  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.049978  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  39.07 
 
 		 414 aa  291  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1821  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 		 403 aa  273  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0709671  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1550  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.267317  hitchhiker  0.0000000000000568319 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0451  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 406 aa  252  7e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.340856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4094  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 		 509 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108712  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3637  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 		 497 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564588 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04480  trehalose synthase, putative  29.68 
 
 		 734 aa  122  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05021  trehalose synthase (Ccg-9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12100)  27.16 
 
 		 705 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.48 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.95 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.2 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  27.2 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  27.2 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.2 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  27.2 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.38 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.2 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.06 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.21 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  27.8 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119517  glycosyl transferase, putative alpha-1,3-mannosyltransferase  27.85 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  30.9 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  36.05 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  36.05 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  36.05 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  30.77 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  27.96 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.71 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  33.77 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 672 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3925  group 1 glycosyl transferase  25.91 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  38.28 
 
 		 725 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  31.22 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  32.43 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  23.79 
 
 		 350 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  35.25 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.39 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3078  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.93 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>