More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2348 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2348  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
411 aa  848    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0363579  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  66.67 
 
 
420 aa  568  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2083  glycosyl transferase, group 1  66.5 
 
 
411 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1740  glycosyl transferase group 1  66.5 
 
 
411 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163685 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0297  glycosyl transferase group 1  55.97 
 
 
411 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0419  glycosyl transferase group 1  48.75 
 
 
413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.102155  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0594  glycosyl transferase, group 1  50.25 
 
 
401 aa  402  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0129  glycosyl transferase, group 1  50.51 
 
 
397 aa  402  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.730138  hitchhiker  0.000955625 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1359  glycosyl transferase, group 1  50.87 
 
 
402 aa  394  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.254886 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0797  glycosyl transferase, group 1  48.5 
 
 
408 aa  381  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2023  glycosyl transferase, group 1  45.45 
 
 
442 aa  342  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1812  glycosyl transferase, group 1  44.19 
 
 
407 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0100815  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  42.12 
 
 
419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  42.01 
 
 
410 aa  318  9e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1718  glycosyl transferase group 1  40.3 
 
 
433 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5908  glycosyl transferase group 1  40.6 
 
 
410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2973  glycosyl transferase, group 1  43.18 
 
 
416 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0542  glycosyl transferase group 1  42.25 
 
 
406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000128948  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  42.11 
 
 
406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3082  glycosyl transferase, group 1  41.81 
 
 
474 aa  298  9e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3832  glycosyl transferase group 1  39.7 
 
 
417 aa  293  3e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672883  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1821  glycosyl transferase, group 1  38.31 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0709671  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  38.21 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0451  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
406 aa  263  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.340856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0427  glycosyl transferase group 1  38.22 
 
 
460 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.049978  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1550  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
398 aa  231  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.267317  hitchhiker  0.0000000000000568319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4094  glycosyl transferase group 1  30.02 
 
 
509 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108712  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3637  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.564588 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04480  trehalose synthase, putative  28.54 
 
 
734 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05021  trehalose synthase (Ccg-9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12100)  29.47 
 
 
705 aa  109  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  30.11 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.5 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 
381 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0134  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.06 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.58 
 
 
420 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
403 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.92 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.92 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  28.92 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  28.92 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  28.92 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.92 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1590  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
468 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00816719  decreased coverage  0.0063014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  32.54 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119517  glycosyl transferase, putative alpha-1,3-mannosyltransferase  25.89 
 
 
480 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
434 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.84 
 
 
365 aa  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
425 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
422 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  28.65 
 
 
393 aa  63.2  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
440 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  33.57 
 
 
443 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  29.67 
 
 
458 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.54 
 
 
769 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
505 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  40 
 
 
369 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
413 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5397  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 
391 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
406 aa  61.6  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
424 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  27.84 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
389 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  31.91 
 
 
480 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
385 aa  59.7  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
482 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.48 
 
 
367 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
370 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
385 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
385 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  28.36 
 
 
424 aa  58.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
672 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 
382 aa  58.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0567  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
437 aa  57.4  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.923327  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
414 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
405 aa  57.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  25.76 
 
 
384 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  37.65 
 
 
419 aa  57  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.35 
 
 
650 aa  56.6  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
348 aa  56.6  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
424 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
381 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
381 aa  56.6  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  36.64 
 
 
422 aa  56.6  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
343 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  26.69 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
856 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>