89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0763 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  57.14 
 
 		 1644 aa  739    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 725 aa  1467    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  56.99 
 
 		 1644 aa  737    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 3301 aa  211  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 		 774 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  36.62 
 
 		 787 aa  169  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 867 aa  167  6.9999999999999995e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  37.86 
 
 		 404 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 		 856 aa  164  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 545 aa  164  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 		 414 aa  164  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 791 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 671 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  37.6 
 
 		 401 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 392 aa  144  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 392 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 		 873 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  31.09 
 
 		 916 aa  141  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  32.07 
 
 		 616 aa  140  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 		 1386 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 389 aa  130  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 1044 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 379 aa  123  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  33 
 
 		 374 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  27.36 
 
 		 383 aa  117  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 624 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 377 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  30.39 
 
 		 1219 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 		 359 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 359 aa  97.8  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 357 aa  97.4  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 679 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 373 aa  91.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1232 aa  90.5  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  26.46 
 
 		 394 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 1233 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  24.2 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  32.34 
 
 		 1635 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  26 
 
 		 759 aa  62  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  38.28 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 387 aa  56.6  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1293  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 407 aa  53.9  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5680  hypothetical protein  34.75 
 
 		 523 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 383 aa  52.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 1080 aa  52.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 410 aa  49.7  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72010  putative glycosyltransferase  33.61 
 
 		 542 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 384 aa  49.7  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 379 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 393 aa  48.9  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 		 346 aa  48.5  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 395 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  23.65 
 
 		 404 aa  47.8  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 345 aa  47.4  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 366 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 348 aa  47.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  29.46 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 394 aa  46.6  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2973  glycosyl transferase, group 1  22 
 
 		 416 aa  46.2  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2023  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 442 aa  46.6  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 382 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  25.71 
 
 		 394 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 		 346 aa  45.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0749  hypothetical protein  25.41 
 
 		 615 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.71 
 
 		 394 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.71 
 
 		 394 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 387 aa  45.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2615  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 		 395 aa  45.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6257  putative glycosyltransferase  26.15 
 
 		 484 aa  45.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 		 371 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 395 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 384 aa  44.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0297  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 411 aa  44.7  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1835  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.94 
 
 		 550 aa  44.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0998709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  23.62 
 
 		 1364 aa  44.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5679  hypothetical protein  31.09 
 
 		 434 aa  44.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0129  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 		 397 aa  44.3  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.730138  hitchhiker  0.000955625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.24 
 
 		 387 aa  44.3  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3753  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 805 aa  44.3  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.115007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72020  hypothetical protein  28.81 
 
 		 433 aa  44.3  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 387 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  28.7 
 
 		 346 aa  44.3  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 409 aa  44.3  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 363 aa  44.3  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 387 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 		 381 aa  44.3  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 409 aa  43.9  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1141  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.85 
 
 		 397 aa  43.9  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>