50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0910 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  100 
 
 
1364 aa  2637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  35.94 
 
 
916 aa  173  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
791 aa  151  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 
3301 aa  108  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
867 aa  83.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
856 aa  81.6  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3985  hypothetical protein  25.16 
 
 
527 aa  76.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0517  hypothetical protein  26.56 
 
 
339 aa  67  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2778  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 
327 aa  65.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  31.84 
 
 
316 aa  64.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
774 aa  62.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  28.69 
 
 
454 aa  63.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  27.27 
 
 
263 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  21.15 
 
 
488 aa  60.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  27.22 
 
 
256 aa  60.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  29.41 
 
 
282 aa  58.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1329  hypothetical protein  25.51 
 
 
450 aa  58.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 
873 aa  57.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  24.59 
 
 
1644 aa  56.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  24.59 
 
 
1644 aa  55.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  29.67 
 
 
351 aa  55.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  30.3 
 
 
321 aa  55.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5781  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 
373 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.820711 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  28.73 
 
 
380 aa  53.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  31.06 
 
 
265 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  30.46 
 
 
265 aa  52.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  24.85 
 
 
296 aa  52.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  28.98 
 
 
255 aa  52.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  30.66 
 
 
268 aa  52  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  21.37 
 
 
723 aa  52  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
545 aa  52  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5202  FkbM family methyltransferase  25.47 
 
 
416 aa  51.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.327791  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  31.69 
 
 
301 aa  51.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  26.6 
 
 
306 aa  51.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  30.38 
 
 
274 aa  50.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  46.77 
 
 
271 aa  50.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
725 aa  50.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  32.39 
 
 
288 aa  49.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  24.89 
 
 
314 aa  49.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  27.41 
 
 
295 aa  48.5  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0123  methyltransferase FkbM family  29.25 
 
 
374 aa  47.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.785695  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1155  FkbM family methyltransferase  25.65 
 
 
301 aa  47.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  25.17 
 
 
297 aa  46.2  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
665 aa  45.8  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03158  putative methyltransferase  24.11 
 
 
266 aa  45.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2581  hypothetical protein  24.91 
 
 
335 aa  45.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2576  methyltransferase FkbM  24.88 
 
 
323 aa  45.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198474  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
378 aa  45.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  26.74 
 
 
278 aa  45.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5961  methyltransferase FkbM family  30.33 
 
 
292 aa  45.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0180421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>