213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00770 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  100 
 
 
916 aa  1831    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  45.21 
 
 
791 aa  558  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
774 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
856 aa  234  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  31.98 
 
 
1364 aa  178  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  34.36 
 
 
1644 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  32.37 
 
 
1644 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  35.15 
 
 
787 aa  169  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 
3301 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 
545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
725 aa  165  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
392 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
389 aa  163  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
414 aa  162  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
392 aa  160  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  37.45 
 
 
404 aa  156  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
1386 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 
873 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
867 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  33.43 
 
 
401 aa  146  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  32.38 
 
 
383 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
671 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
1044 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
373 aa  124  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
374 aa  112  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
377 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
624 aa  102  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
679 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
616 aa  99  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2577  hypothetical protein  29.27 
 
 
356 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
379 aa  95.1  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
359 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
357 aa  91.3  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 
359 aa  87.8  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  27.65 
 
 
1232 aa  87.4  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2778  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5781  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
373 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.820711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0150  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240028  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  26.54 
 
 
1219 aa  79  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0517  hypothetical protein  27.1 
 
 
339 aa  76.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1329  hypothetical protein  23.92 
 
 
450 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  28.46 
 
 
376 aa  69.7  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  26 
 
 
1635 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72010  putative glycosyltransferase  33.87 
 
 
542 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3985  hypothetical protein  25.61 
 
 
527 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
995 aa  62.8  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  38.54 
 
 
394 aa  62  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
393 aa  60.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5680  hypothetical protein  26.4 
 
 
523 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5908  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
410 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
1233 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0749  hypothetical protein  29.73 
 
 
615 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
384 aa  58.2  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
409 aa  57.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
424 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
419 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
367 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
623 aa  56.2  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 
379 aa  55.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 
350 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
371 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2973  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
416 aa  55.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2254  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
358 aa  55.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0765492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  26.4 
 
 
364 aa  54.7  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2581  hypothetical protein  26.55 
 
 
335 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1448  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.59 
 
 
502 aa  54.3  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.622489  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0797  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 
408 aa  53.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3832  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
417 aa  53.5  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672883  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
400 aa  53.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1359  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
402 aa  52.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.254886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
362 aa  52.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 
367 aa  52  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2348  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
411 aa  51.6  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0363579  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
379 aa  51.6  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
344 aa  51.6  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
387 aa  51.2  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
871 aa  51.2  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
384 aa  51.2  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  30 
 
 
353 aa  50.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
362 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 
347 aa  50.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
349 aa  50.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
346 aa  50.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05710  glycosyltransferase  31.73 
 
 
379 aa  50.4  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0419  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
413 aa  50.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.102155  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0423  hypothetical protein  24.17 
 
 
323 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
366 aa  50.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  31.62 
 
 
460 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
387 aa  50.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  45.1 
 
 
303 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.27 
 
 
371 aa  49.3  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  26.88 
 
 
380 aa  49.7  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  39.53 
 
 
378 aa  49.3  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0594  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
401 aa  49.3  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
402 aa  49.3  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1901  putative glycosyltransferase  26.9 
 
 
793 aa  48.9  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537767  normal  0.403992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3184  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
389 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  31.91 
 
 
406 aa  48.9  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0297  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
411 aa  49.3  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>