207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4003 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
545 aa  1107    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  37.02 
 
 
867 aa  265  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 
856 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  38.4 
 
 
414 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  34.12 
 
 
787 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 
791 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  35.01 
 
 
774 aa  180  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
392 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
1386 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
725 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.04 
 
 
3301 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
671 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
392 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  31.22 
 
 
1644 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  31.22 
 
 
1644 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 
379 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  32.88 
 
 
383 aa  158  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  37.96 
 
 
401 aa  156  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
404 aa  153  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  36.02 
 
 
916 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 
389 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
873 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
1044 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
373 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
374 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
679 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
357 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 
377 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
624 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
359 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
359 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
616 aa  96.7  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  28.52 
 
 
1219 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
332 aa  88.2  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  25.77 
 
 
1232 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.51 
 
 
390 aa  64.7  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
1233 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3861  hypothetical protein  21.74 
 
 
583 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
375 aa  58.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  23.16 
 
 
376 aa  58.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  27.34 
 
 
1364 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  23.01 
 
 
394 aa  56.2  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
386 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
384 aa  54.3  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  32.3 
 
 
420 aa  53.9  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
426 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
409 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
409 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
346 aa  53.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  26.25 
 
 
1635 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
387 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
345 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.82 
 
 
409 aa  51.6  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
396 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
384 aa  50.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
370 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
370 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
930 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  26.73 
 
 
400 aa  50.8  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
384 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
395 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
387 aa  50.4  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
1229 aa  50.1  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
1241 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4007  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0399427  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  28.4 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
744 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 
402 aa  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.71 
 
 
385 aa  49.3  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2416  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
391 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0844793  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
347 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  38.03 
 
 
377 aa  49.3  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0893  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.021774  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
1261 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
378 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
382 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
1089 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
382 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
373 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  30.83 
 
 
377 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
390 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
395 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3011  putative glycosyltransferase  27.91 
 
 
380 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
371 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2083  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
411 aa  48.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1740  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
411 aa  48.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
410 aa  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
378 aa  47.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6700  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
396 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0797  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
408 aa  47.8  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  42.65 
 
 
381 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0710  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.47 
 
 
444 aa  47.4  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  26.67 
 
 
443 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
371 aa  47.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
364 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  30.99 
 
 
422 aa  47.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3410  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
366 aa  47.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.88 
 
 
373 aa  47.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1812  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
407 aa  47.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0100815  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
372 aa  47.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>