45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2068 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  780    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  40.92 
 
 		 376 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 		 624 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 		 616 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 		 679 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 377 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 		 359 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  28.71 
 
 		 1644 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  28.71 
 
 		 1644 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 357 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  27.71 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  27.39 
 
 		 787 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 3301 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 725 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 671 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  23.48 
 
 		 856 aa  83.2  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 1233 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  27.74 
 
 		 1635 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  26.44 
 
 		 1219 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 		 1386 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  41.03 
 
 		 916 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 545 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 332 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 1044 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 		 867 aa  62.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1232 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  25.63 
 
 		 759 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 774 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 		 791 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.71 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  21.26 
 
 		 873 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  25.7 
 
 		 995 aa  43.9  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  28.26 
 
 		 422 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0749  hypothetical protein  23.91 
 
 		 615 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>