40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2706 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 373 aa  769    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  35.69 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  37.58 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 		 856 aa  159  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  32.39 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 		 1386 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  33.14 
 
 		 787 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 545 aa  126  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 3301 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 791 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  34.96 
 
 		 916 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 671 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 774 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 873 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 867 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 		 1044 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  32.46 
 
 		 1644 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  32.46 
 
 		 1644 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 725 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 616 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 624 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 679 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  25.5 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  28.57 
 
 		 1219 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  24.29 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 1233 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1232 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  28.57 
 
 		 1635 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 995 aa  43.5  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>