94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2454 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  100 
 
 
383 aa  774    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
392 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 
414 aa  183  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  36.82 
 
 
404 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 
401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
545 aa  152  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
856 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
3301 aa  139  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
873 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
373 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
867 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  31.61 
 
 
916 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
1386 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
791 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  27.51 
 
 
1644 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  27.51 
 
 
1644 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
774 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  33.97 
 
 
787 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
725 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
671 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
1044 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
379 aa  94  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
359 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 
679 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
624 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
616 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  26.22 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
332 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  22.27 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  25.35 
 
 
376 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
995 aa  57.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  23.03 
 
 
1219 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
409 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  28.18 
 
 
379 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
507 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 
623 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3861  hypothetical protein  23.4 
 
 
583 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
416 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  25.71 
 
 
1635 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72010  putative glycosyltransferase  31.43 
 
 
542 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 
1233 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
378 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
381 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5680  hypothetical protein  31.86 
 
 
523 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
384 aa  46.6  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
405 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1342  glycosyl transferase, group 1  40.62 
 
 
366 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1660  diacylglycerol kinase  30.93 
 
 
521 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1039  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 
344 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147415  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1412  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1855  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2294  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0390  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1007  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204668  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1274  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2271  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693911  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1267  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0759  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1107  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.93 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0749  hypothetical protein  25 
 
 
615 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0940  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
375 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1408  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.306452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  30.93 
 
 
343 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1453  hypothetical protein  27.27 
 
 
356 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1744  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  45.28 
 
 
371 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2028  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0125805  normal  0.984429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2924  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
350 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4088  glycosyl transferase, group 1  36.14 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
345 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.52 
 
 
385 aa  43.5  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
371 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0904  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
372 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4237  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
361 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.905319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  30.77 
 
 
379 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
816 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
471 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  28.97 
 
 
367 aa  43.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  30.38 
 
 
456 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  30.38 
 
 
456 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1772  group 1 glycosyl transferase  36.46 
 
 
392 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>