More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1744 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1744  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
348 aa  672    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1745  glycosyl transferase group 1  36.1 
 
 
358 aa  143  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0374  glycosyltransferase  25.84 
 
 
351 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
1233 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 
1267 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4199  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
368 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
395 aa  87  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  33.86 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
408 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
452 aa  84  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2760  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
1039 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  36.28 
 
 
405 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  34.16 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 
376 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1094  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  36.05 
 
 
397 aa  77  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
382 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
1267 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  35.32 
 
 
384 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2598  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 
455 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  40.12 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  35.43 
 
 
935 aa  72.8  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  37.95 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  37.74 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
500 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  37.64 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  33.49 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  26.09 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
419 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  28.57 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  35.75 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  39.68 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  43 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  34.85 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  36.09 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 
445 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  34.86 
 
 
403 aa  69.3  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
370 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  27.98 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.31 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  37.78 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  41.73 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  35.14 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>