More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4199 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4199  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 368 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0374  glycosyltransferase  27.25 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1744  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 348 aa  91.3  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  29.41 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1745  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 1267 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.76 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  35 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  35 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.03 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.03 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.03 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.03 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.03 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 		 1233 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  36.59 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0340  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0102921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  33.12 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.32 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0447  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.429575 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  23.18 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0862  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  26.36 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  25.7 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 431 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  31.62 
 
 		 372 aa  67  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 		 433 aa  67  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  31.58 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  31.62 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  31.69 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.67 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  31.47 
 
 		 1635 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>