More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0663 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
433 aa  892    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  50.23 
 
 
464 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  47.24 
 
 
442 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  44.88 
 
 
435 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  42.7 
 
 
443 aa  359  7e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  45.52 
 
 
440 aa  355  7.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  41.65 
 
 
423 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  38.25 
 
 
428 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  36.26 
 
 
430 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0645  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
389 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.924062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  36.65 
 
 
390 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 
370 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 
364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 
370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  32.23 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
380 aa  131  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  33.33 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
400 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.36 
 
 
382 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
381 aa  128  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
377 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 
376 aa  127  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
382 aa  126  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
371 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  32.36 
 
 
381 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
381 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
374 aa  124  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
395 aa  123  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
371 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  28.37 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
434 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
381 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
384 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
384 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  34.09 
 
 
375 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
385 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
378 aa  119  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.66 
 
 
375 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
366 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  29.08 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  33.71 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
370 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
376 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
398 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
372 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
389 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
346 aa  113  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 
408 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  33.1 
 
 
346 aa  113  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 
394 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
420 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
376 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
535 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  34.26 
 
 
343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1887  mannosyltransferase  26.37 
 
 
430 aa  111  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
386 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  31.13 
 
 
382 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
376 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 
360 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
374 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 
340 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
398 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  29.45 
 
 
373 aa  108  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
384 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  32.39 
 
 
372 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  32.39 
 
 
372 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
378 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 
471 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
374 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
366 aa  106  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
378 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
358 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
373 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
417 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
393 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
437 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0277  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
503 aa  104  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  26.9 
 
 
336 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
361 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  33.33 
 
 
361 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
366 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
378 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>