More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3491 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
440 aa  877    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  53.14 
 
 
464 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  45.37 
 
 
435 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  45.52 
 
 
433 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  43.58 
 
 
442 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  43.75 
 
 
443 aa  360  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  48.3 
 
 
423 aa  345  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  34.59 
 
 
430 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  35.91 
 
 
428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 
390 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0645  glycosyl transferase group 1  37.96 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.924062 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  35.27 
 
 
382 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 
381 aa  146  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  39.78 
 
 
370 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
387 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
387 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  34.78 
 
 
373 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
380 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  33.45 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
417 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
364 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
360 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  37.78 
 
 
370 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  37.41 
 
 
340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
370 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
384 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
380 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
373 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  30.51 
 
 
364 aa  124  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
371 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 
381 aa  123  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
395 aa  123  8e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  34.54 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
437 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  34.64 
 
 
353 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
357 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  33.92 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
398 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
376 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 
366 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
378 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  27.46 
 
 
375 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.55 
 
 
361 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  37.55 
 
 
361 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.11 
 
 
375 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.55 
 
 
401 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  38.14 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.55 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.55 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.55 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.55 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  30.58 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  30.58 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
346 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
372 aa  111  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  35.06 
 
 
346 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.85 
 
 
364 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
373 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  30.08 
 
 
374 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
390 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 
376 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 
408 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 
382 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 
382 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  32.79 
 
 
380 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0277  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
503 aa  106  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  30.58 
 
 
374 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
375 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
831 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1887  mannosyltransferase  28.44 
 
 
430 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
384 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
381 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
394 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
385 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
373 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
389 aa  103  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
366 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 
394 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
372 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>