More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0625 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
372 aa  768    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  44.68 
 
 
378 aa  308  9e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  42.67 
 
 
378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  43.65 
 
 
376 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  42.97 
 
 
374 aa  278  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  39.73 
 
 
372 aa  269  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 
376 aa  245  8e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
400 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
408 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
374 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
393 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
369 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
386 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
370 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
370 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
374 aa  150  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
371 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 
428 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
371 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
375 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
387 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
387 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
385 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
417 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
381 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
380 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
376 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.48 
 
 
375 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
382 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 
370 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
372 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
431 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.44 
 
 
375 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
382 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
377 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
366 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
435 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  26.98 
 
 
374 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
393 aa  126  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
360 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 
535 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
394 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
383 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
398 aa  122  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  30.56 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
373 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.99 
 
 
364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
443 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
361 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
1261 aa  116  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
381 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
361 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
384 aa  113  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
371 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  27.24 
 
 
353 aa  112  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
389 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
1398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
378 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  26.72 
 
 
372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  26.97 
 
 
364 aa  109  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
376 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  26.96 
 
 
381 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
374 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  26.46 
 
 
372 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
364 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
375 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
377 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.97 
 
 
361 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  26.97 
 
 
361 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
354 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
377 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.97 
 
 
414 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.97 
 
 
414 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.97 
 
 
414 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.97 
 
 
414 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>