More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0377 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
378 aa  788    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  35.69 
 
 
408 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  31.88 
 
 
351 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 
374 aa  149  9e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
390 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
376 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
378 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  32.73 
 
 
430 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
393 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
384 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
386 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
387 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
387 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
380 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
370 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
417 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 
1261 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
360 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  25.81 
 
 
374 aa  123  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
390 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
370 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
435 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.56 
 
 
364 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
371 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
375 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2280  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00320483  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  28.34 
 
 
375 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
381 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  28.48 
 
 
375 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  31.06 
 
 
364 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.47 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  28.47 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.47 
 
 
414 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.47 
 
 
414 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.47 
 
 
414 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.47 
 
 
414 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.47 
 
 
401 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 
390 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
368 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  28.9 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  30.15 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
372 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
340 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
371 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
431 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
366 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
386 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
397 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
380 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
372 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
444 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
420 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
380 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  28.76 
 
 
336 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.89 
 
 
369 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.66 
 
 
381 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
382 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
361 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
394 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  26.76 
 
 
1219 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  27.7 
 
 
380 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
384 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
378 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
1241 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
364 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
394 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
385 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>