More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1159 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  40.89 
 
 		 1089 aa  749    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  45.49 
 
 		 1915 aa  1132    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 1398 aa  2888    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  42.03 
 
 		 1229 aa  926    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  46.39 
 
 		 1241 aa  1085    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  47.39 
 
 		 1241 aa  1118    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  46.79 
 
 		 1261 aa  1120    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  44.48 
 
 		 1243 aa  982    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  43.79 
 
 		 1028 aa  788    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  53.73 
 
 		 609 aa  627  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  39.59 
 
 		 1332 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 		 838 aa  380  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  45.91 
 
 		 831 aa  373  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.63 
 
 		 815 aa  326  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  30.65 
 
 		 1635 aa  325  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  28.21 
 
 		 743 aa  316  1.9999999999999998e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  44.17 
 
 		 846 aa  315  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  43.92 
 
 		 846 aa  313  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 		 850 aa  300  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  37.96 
 
 		 860 aa  290  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  42.54 
 
 		 431 aa  288  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  36.96 
 
 		 859 aa  286  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1232 aa  253  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  34.41 
 
 		 1219 aa  232  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 967 aa  231  8e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  36.25 
 
 		 460 aa  193  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  35.95 
 
 		 460 aa  192  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 		 395 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  33.98 
 
 		 455 aa  172  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 386 aa  159  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 382 aa  157  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 		 394 aa  154  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 		 371 aa  151  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 		 482 aa  150  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 400 aa  149  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 		 370 aa  146  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  30.5 
 
 		 381 aa  144  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  31.1 
 
 		 381 aa  144  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0106  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 469 aa  144  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.341014  normal  0.913948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 		 417 aa  142  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 376 aa  142  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 		 374 aa  142  6e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 480 aa  142  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 434 aa  140  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 		 382 aa  138  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 394 aa  139  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  34.77 
 
 		 397 aa  138  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 378 aa  138  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 366 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 382 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0191  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 779 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 		 431 aa  137  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  33.82 
 
 		 351 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 370 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 375 aa  135  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 451 aa  135  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 373 aa  135  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  34.47 
 
 		 381 aa  134  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  30.6 
 
 		 375 aa  134  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 408 aa  134  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  30.6 
 
 		 375 aa  134  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 435 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 384 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 		 385 aa  132  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 		 380 aa  129  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 377 aa  128  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 382 aa  128  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 		 386 aa  127  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 370 aa  126  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 		 360 aa  126  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 382 aa  125  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1976  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 541 aa  125  8e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0537449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 395 aa  124  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 381 aa  123  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 384 aa  122  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 381 aa  122  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 420 aa  122  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 393 aa  122  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 374 aa  121  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 		 535 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 394 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 		 444 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 369 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1975  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 763 aa  120  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.422047  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2369  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 		 770 aa  120  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 378 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 374 aa  119  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 381 aa  119  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 346 aa  119  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  29.79 
 
 		 346 aa  119  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 390 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 380 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 		 383 aa  117  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 373 aa  116  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 366 aa  116  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  31.07 
 
 		 373 aa  116  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.03 
 
 		 364 aa  115  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 384 aa  115  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 		 389 aa  115  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 384 aa  115  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>