More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5686 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 455 aa  936    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  63.68 
 
 		 460 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  63.24 
 
 		 460 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  36.86 
 
 		 1635 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 850 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 1261 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 		 967 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 1398 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 		 831 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 		 838 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.7 
 
 		 815 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 		 1243 aa  162  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  36.01 
 
 		 1241 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  33.23 
 
 		 1241 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 1229 aa  160  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 		 846 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  35.05 
 
 		 846 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  35.21 
 
 		 431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  30.31 
 
 		 859 aa  140  6e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 860 aa  138  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 		 1332 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 		 1915 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1976  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0537449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 		 413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  28.98 
 
 		 383 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  32.21 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.21 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.21 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  31.84 
 
 		 383 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  31.84 
 
 		 383 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  31.84 
 
 		 383 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  31.84 
 
 		 383 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  29.89 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 		 434 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  30.06 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  31.78 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 494 aa  100  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 773 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 435 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 381 aa  97.1  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 423 aa  97.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 435 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 434 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 		 381 aa  95.5  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 		 386 aa  94.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 817 aa  94  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 437 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 412 aa  93.6  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 354 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  40.77 
 
 		 355 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 420 aa  90.1  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 784 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 449 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  25.09 
 
 		 743 aa  86.7  9e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  27.69 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  25.94 
 
 		 1219 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0277  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 370 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  28.83 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>