More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2724 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 430 aa  867    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  43.76 
 
 		 456 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  43.09 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  43.31 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  42.29 
 
 		 426 aa  307  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  44.32 
 
 		 459 aa  306  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  43.72 
 
 		 434 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  40.65 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  40.65 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  43.19 
 
 		 388 aa  225  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  37.86 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  33.41 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  41.39 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  42.18 
 
 		 399 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  42.45 
 
 		 321 aa  216  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  34.03 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  34.03 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  34.03 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  34.03 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  34.03 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.44 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.44 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 		 384 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 		 383 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 		 426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  42.59 
 
 		 413 aa  196  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  34.29 
 
 		 384 aa  176  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  34.94 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  32.48 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  24.65 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 		 412 aa  136  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 817 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 784 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 		 415 aa  103  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 773 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  37.84 
 
 		 355 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 443 aa  97.1  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 		 390 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  32.56 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 535 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.24 
 
 		 374 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 		 366 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 437 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 494 aa  90.1  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  41.35 
 
 		 366 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  25.09 
 
 		 520 aa  89.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  33.98 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 387 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 387 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  34.36 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 1241 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 380 aa  88.2  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0277  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 503 aa  88.2  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 1243 aa  87.4  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 489 aa  87.4  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 		 381 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 373 aa  86.7  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 		 370 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  30 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.78 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.78 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 524 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2369  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 503 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182405 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  28.26 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  34.19 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  26.83 
 
 		 743 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  29.03 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2303  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.05 
 
 		 507 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500428  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2181  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.05 
 
 		 507 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1074  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.05 
 
 		 507 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0525  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.05 
 
 		 507 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.317265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>