More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3839 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 444 aa  899    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  81.74 
 
 		 449 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  71.73 
 
 		 441 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  37.38 
 
 		 520 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  37.84 
 
 		 494 aa  177  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  35.92 
 
 		 784 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 		 817 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0744  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 1666 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 		 773 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2029  glycosyl transferase, group 1  39.24 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758751 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 489 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 		 420 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3833  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 		 477 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00330118  normal  0.252696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  25.99 
 
 		 384 aa  97.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 426 aa  97.1  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 524 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 535 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 413 aa  94  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  23.4 
 
 		 447 aa  93.2  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 387 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 387 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 455 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 399 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  23.36 
 
 		 417 aa  87  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  30.34 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  30.34 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  27.99 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  27.69 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  30.34 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  30.34 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  30.34 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.34 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.34 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  27.69 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  28.16 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  29.87 
 
 		 1232 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.34 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6405  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  24.65 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  24.65 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 		 1089 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  31.92 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  31.92 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  26.55 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  23.85 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  23.84 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  22.18 
 
 		 1219 aa  73.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3559  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23554  normal  0.448657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  36.03 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0476116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>