More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3833 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3833  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 477 aa  984    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00330118  normal  0.252696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2029  glycosyl transferase, group 1  47.27 
 
 		 282 aa  229  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 494 aa  146  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 		 784 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 817 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  29.22 
 
 		 520 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 489 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0744  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 1666 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 773 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 449 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 441 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  25.9 
 
 		 383 aa  94  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.9 
 
 		 372 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.9 
 
 		 372 aa  94  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  25.54 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  25.54 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  25.54 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  25.54 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 399 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 384 aa  89  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 388 aa  87  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  41.61 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.9 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 370 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 376 aa  79.7  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  30.99 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  23.8 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  32.1 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  29.69 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 535 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2357  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 		 378 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106169  hitchhiker  0.000521523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  26.05 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 377 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0277  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 503 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 366 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 1398 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  25.18 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  24.66 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  33.33 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  28.84 
 
 		 1219 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2932  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  24.91 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4068  group 1 glycosyl transferase  26.83 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.736051  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3164  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  31.06 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  27.44 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 373 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  28.52 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.89 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.28 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.28 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>