More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5364 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
432 aa  845    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  78.67 
 
 
435 aa  623  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  78.67 
 
 
435 aa  623  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  78.49 
 
 
434 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  66.74 
 
 
459 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  65.15 
 
 
456 aa  511  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  65.38 
 
 
456 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  60.42 
 
 
426 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  43.09 
 
 
430 aa  317  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  40.1 
 
 
386 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  37.41 
 
 
388 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  38.66 
 
 
383 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  38.79 
 
 
384 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  41.61 
 
 
420 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  39.19 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  34.67 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  34.67 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  34.67 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  34.67 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  34.43 
 
 
383 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  38.14 
 
 
423 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  42.59 
 
 
321 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 
420 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.13 
 
 
372 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.86 
 
 
372 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  49.35 
 
 
413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  33.41 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  33.41 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 
426 aa  189  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  35.03 
 
 
384 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  33.21 
 
 
417 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  27.01 
 
 
447 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  32.08 
 
 
412 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
412 aa  147  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
415 aa  117  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
494 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  34.08 
 
 
455 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
1241 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.17 
 
 
815 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  33.33 
 
 
1635 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  34.21 
 
 
460 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
444 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  33.77 
 
 
460 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
784 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
817 aa  97.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
449 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 
1241 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1976  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
541 aa  93.2  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0537449  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  33.33 
 
 
859 aa  93.2  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
860 aa  92.8  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
838 aa  92.8  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
846 aa  92.4  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
967 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  29.79 
 
 
846 aa  92  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  28.09 
 
 
520 aa  92.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
850 aa  90.9  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
434 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
831 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
380 aa  89  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
1243 aa  87.8  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
1229 aa  87  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  41.56 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 
437 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  44 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
773 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2181  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.64 
 
 
507 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2303  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.64 
 
 
507 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0525  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.64 
 
 
507 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.317265  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3298  WcbE  36.64 
 
 
507 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00149764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3250  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.64 
 
 
507 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1074  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.64 
 
 
507 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109997  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  32.54 
 
 
375 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
1261 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3285  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.64 
 
 
507 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754197  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  31.08 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  26.85 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
381 aa  77  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 
384 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  33.64 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>