More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5026 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  86.55 
 
 
456 aa  754    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
459 aa  897    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  86.98 
 
 
456 aa  757    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  64.93 
 
 
432 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  60.6 
 
 
426 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  63.82 
 
 
434 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  60.32 
 
 
435 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  60.32 
 
 
435 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  44.62 
 
 
430 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  38.13 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  40.23 
 
 
383 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  38.99 
 
 
384 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  44.92 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  47.14 
 
 
386 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  45 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  36.05 
 
 
383 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  36.05 
 
 
383 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  36.05 
 
 
383 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  36.05 
 
 
383 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  40.42 
 
 
420 aa  237  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  36.05 
 
 
383 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  39.07 
 
 
423 aa  229  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 
399 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.1 
 
 
372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.28 
 
 
372 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  39.44 
 
 
420 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  38.26 
 
 
389 aa  196  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  38.26 
 
 
389 aa  196  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  48.33 
 
 
413 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
426 aa  176  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  33.33 
 
 
384 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  31.91 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  26.17 
 
 
447 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  31.21 
 
 
412 aa  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  37.71 
 
 
412 aa  139  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
415 aa  120  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
494 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  33.67 
 
 
431 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 
455 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  32.89 
 
 
460 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  33.33 
 
 
460 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  32.13 
 
 
1635 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  35.63 
 
 
859 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
1241 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
860 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 
784 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
817 aa  97.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
1243 aa  97.4  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
838 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  27.04 
 
 
520 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
850 aa  96.3  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 
815 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 
1241 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
831 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
370 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 
354 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
387 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
387 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
376 aa  89  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  34.25 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
489 aa  88.2  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
371 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
370 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
773 aa  87.4  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
381 aa  87.4  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
346 aa  87  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
1261 aa  87  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  32.26 
 
 
346 aa  87  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
366 aa  86.3  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
449 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  36.68 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1976  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
541 aa  85.1  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0537449  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  29.34 
 
 
846 aa  84.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
967 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
846 aa  84.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
1229 aa  84  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
441 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
444 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
434 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  29.65 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  29.65 
 
 
372 aa  79.7  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
340 aa  79.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  37.24 
 
 
375 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  27.23 
 
 
743 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2616  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 
524 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>