More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4511 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 456 aa  900    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  86.98 
 
 		 459 aa  735    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  98.68 
 
 		 456 aa  889    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  64.24 
 
 		 432 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  61.25 
 
 		 426 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  60.73 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  60.73 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  64.04 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  43.76 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  40.23 
 
 		 388 aa  256  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  40.42 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  36.66 
 
 		 383 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  39.59 
 
 		 383 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  38.39 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  40.28 
 
 		 420 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  36.3 
 
 		 383 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  36.3 
 
 		 383 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  36.3 
 
 		 383 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  36.3 
 
 		 383 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  39.25 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  36.3 
 
 		 383 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  44.85 
 
 		 321 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.36 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.12 
 
 		 372 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  36.53 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  38.44 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 389 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 389 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  47.35 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  34.47 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  28.54 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  28.9 
 
 		 384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  31.65 
 
 		 412 aa  159  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  27.11 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 		 412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 		 455 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  30.89 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 		 784 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 1241 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  33.33 
 
 		 460 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  32.49 
 
 		 460 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  32.75 
 
 		 1635 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 817 aa  98.2  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  34.25 
 
 		 859 aa  98.2  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 		 860 aa  97.1  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 850 aa  97.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 838 aa  95.5  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 1243 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 		 370 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 1241 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 		 815 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 831 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 382 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  27.01 
 
 		 520 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 1261 aa  92  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 441 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 381 aa  90.5  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 		 449 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  29.71 
 
 		 846 aa  89.7  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 846 aa  89.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 387 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 387 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 		 376 aa  87  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 354 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  39.26 
 
 		 366 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 967 aa  87  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 377 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 		 346 aa  86.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  32.17 
 
 		 346 aa  86.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  33.48 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 1398 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1976  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 		 541 aa  83.6  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0537449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 489 aa  83.2  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 		 773 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 		 1229 aa  81.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7046  putative glycosyltransferase  29.29 
 
 		 473 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.378884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 343 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  37.87 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  28.98 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>