More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2590 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
389 aa  789    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
389 aa  789    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  45.43 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  42.53 
 
 
386 aa  296  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  41.9 
 
 
388 aa  292  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  41.58 
 
 
384 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  40.57 
 
 
383 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  40.57 
 
 
383 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  40.57 
 
 
383 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  40.57 
 
 
383 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  40.57 
 
 
383 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 
383 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  40.99 
 
 
399 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.79 
 
 
372 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.11 
 
 
372 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  42.24 
 
 
321 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
426 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  34.2 
 
 
417 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  31.25 
 
 
384 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
456 aa  202  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
456 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
432 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  38.97 
 
 
459 aa  189  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 
434 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
420 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 
426 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
430 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
423 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  29.95 
 
 
412 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
415 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  35.32 
 
 
460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  24.24 
 
 
447 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  34.89 
 
 
460 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
494 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
817 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
1241 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
850 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  30.93 
 
 
520 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  32.09 
 
 
431 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
455 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  29.57 
 
 
1635 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  33.74 
 
 
859 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
860 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
371 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
376 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
400 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  28.76 
 
 
743 aa  101  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
366 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
444 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
1229 aa  100  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
1241 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
384 aa  99.8  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
1243 aa  99.4  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
387 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 
449 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
377 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
387 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
773 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  32.2 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  31.82 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
358 aa  97.1  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
784 aa  96.3  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
435 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.74 
 
 
815 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
967 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
838 aa  94  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 
471 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 
408 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
366 aa  93.6  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1976  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
541 aa  93.2  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0537449  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
1261 aa  93.6  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
441 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
370 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
384 aa  92.8  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
382 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  32.16 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
1398 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
381 aa  90.1  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
361 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
371 aa  89.7  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
417 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  31.52 
 
 
353 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  31.52 
 
 
353 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
376 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
361 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  31.52 
 
 
353 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.86 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>