More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5069 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  78.49 
 
 
432 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
434 aa  833    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  78.69 
 
 
435 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  78.69 
 
 
435 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  64.95 
 
 
459 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  63.62 
 
 
456 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  63.82 
 
 
456 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  59.95 
 
 
426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  43.72 
 
 
430 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  39.38 
 
 
386 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 
388 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  42.34 
 
 
420 aa  243  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  38.72 
 
 
383 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  37.62 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  37.62 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  37.95 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  37.62 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  37.62 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 
383 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  37.38 
 
 
383 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  42.04 
 
 
420 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  39.23 
 
 
423 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  42.66 
 
 
321 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.65 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.65 
 
 
372 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  36.3 
 
 
399 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  37.88 
 
 
413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
389 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
389 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
426 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  35.21 
 
 
384 aa  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  33.57 
 
 
417 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  33.17 
 
 
412 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  26.4 
 
 
447 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  35.82 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  33.97 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  34.68 
 
 
1635 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  33.63 
 
 
455 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
838 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
1241 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.84 
 
 
815 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  34.17 
 
 
859 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
860 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  31.15 
 
 
460 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
1241 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  31.56 
 
 
460 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
1261 aa  97.1  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
1243 aa  95.9  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
831 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
846 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
850 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  31.56 
 
 
846 aa  94.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 
381 aa  94.4  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  33.97 
 
 
375 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
1229 aa  90.5  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
381 aa  90.5  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
377 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  34.35 
 
 
375 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
449 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
817 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 
784 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  30.04 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
433 aa  88.2  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
376 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  31.77 
 
 
773 aa  87.8  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
443 aa  87.4  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
444 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  33.47 
 
 
370 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 
434 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
489 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
437 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  35.55 
 
 
354 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
382 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
370 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  35.63 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  40.58 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
363 aa  82.8  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 
1398 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1976  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
541 aa  81.3  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0537449  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  25.42 
 
 
743 aa  80.1  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  28.72 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
967 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
346 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2616  glycosyl transferase group 1  37.41 
 
 
524 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>