More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2295 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 412 aa  785    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  38.57 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  36.65 
 
 		 415 aa  182  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  32.75 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  32.75 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  32.75 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  32.75 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  32.77 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 		 432 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 		 384 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  34.7 
 
 		 459 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 456 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 		 426 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.24 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  37.24 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  33.17 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.99 
 
 		 372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 		 426 aa  139  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 435 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 435 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  38.68 
 
 		 434 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  28.78 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  27.27 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  35.41 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 420 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 		 420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  38.78 
 
 		 423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  30.5 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 		 815 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 860 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  31.93 
 
 		 859 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 		 494 aa  107  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 		 784 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  36.03 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  33.33 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 		 455 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  33.86 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 		 382 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  37.34 
 
 		 375 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 		 366 aa  99.8  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  31.22 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 		 1229 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  30.8 
 
 		 460 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 408 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 1398 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  22.13 
 
 		 384 aa  94.4  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 		 1241 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 		 817 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 		 371 aa  93.2  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 393 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 		 1243 aa  93.2  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 400 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 831 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 1241 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 370 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 		 846 aa  90.5  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  31.88 
 
 		 846 aa  90.5  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 381 aa  90.5  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 384 aa  90.1  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 382 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.27 
 
 		 430 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 371 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 		 428 aa  89.7  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 		 431 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 850 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 433 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0277  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 503 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0415  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 382 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 		 838 aa  86.7  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 426 aa  86.7  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 		 435 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  31.39 
 
 		 381 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 340 aa  86.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>