More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0643 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
413 aa  832    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  49.59 
 
 
423 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  47.81 
 
 
420 aa  273  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  43.68 
 
 
420 aa  259  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  43.68 
 
 
384 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  38.75 
 
 
383 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  40.79 
 
 
386 aa  223  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  37.7 
 
 
383 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  37.7 
 
 
383 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  37.7 
 
 
383 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  37.7 
 
 
383 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  39.73 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 
434 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  38.41 
 
 
426 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 
432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  39.95 
 
 
383 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  37.59 
 
 
383 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.09 
 
 
372 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.09 
 
 
372 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  37.08 
 
 
435 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  37.08 
 
 
435 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  38.54 
 
 
399 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  46.95 
 
 
321 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  36.82 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 
456 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
430 aa  199  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 
459 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 
389 aa  190  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
389 aa  190  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  36.55 
 
 
426 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  29.57 
 
 
417 aa  163  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  32.53 
 
 
384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  33.68 
 
 
412 aa  153  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  27.18 
 
 
447 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 
412 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  29.92 
 
 
460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  29.51 
 
 
460 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  35.25 
 
 
375 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  33.19 
 
 
375 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
831 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
376 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 
815 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
838 aa  103  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  33.47 
 
 
1635 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
1398 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
773 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 
1241 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  33.82 
 
 
379 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
860 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  32.19 
 
 
859 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 
1261 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
850 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
434 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
1241 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
420 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
370 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 
370 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
381 aa  95.5  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
1243 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
380 aa  94.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  35.78 
 
 
390 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
444 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
449 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
354 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
435 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  28.69 
 
 
520 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  29.41 
 
 
431 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  36.42 
 
 
366 aa  89.7  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
441 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 
370 aa  89  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7046  putative glycosyltransferase  33.62 
 
 
473 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.378884  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
364 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
371 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  28.57 
 
 
364 aa  87  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
435 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
967 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
364 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
817 aa  87  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
395 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  30.47 
 
 
374 aa  86.3  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
417 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>