More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0232 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 489 aa  979    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3833  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 		 477 aa  126  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00330118  normal  0.252696 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 		 494 aa  123  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2029  glycosyl transferase, group 1  38.51 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 441 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 784 aa  113  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 773 aa  110  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  35.02 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 449 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 817 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0744  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 1666 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 371 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 420 aa  94.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  28.42 
 
 		 417 aa  91.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 383 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 430 aa  90.9  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 431 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 		 370 aa  90.1  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  29.37 
 
 		 383 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 		 426 aa  88.6  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  29.37 
 
 		 383 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4006  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 393 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  29.37 
 
 		 383 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  29.37 
 
 		 383 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.43 
 
 		 372 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  29.43 
 
 		 383 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.43 
 
 		 372 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 		 386 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 		 412 aa  87.4  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 		 417 aa  87  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 388 aa  86.7  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.5 
 
 		 381 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  36.72 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4007  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0399427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  25.08 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  27.68 
 
 		 383 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 443 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 426 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.57 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2369  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  23.39 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  26.47 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 370 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25.1 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  27.54 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.21 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  29.01 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 524 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  26 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  27.44 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  24.33 
 
 		 1219 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 535 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0277  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 503 aa  73.6  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2616  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 524 aa  73.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3008  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 524 aa  73.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>