More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp3020 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  854    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  55.91 
 
 
384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  40.05 
 
 
384 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  39.21 
 
 
383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  40.27 
 
 
388 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  38.92 
 
 
399 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  36.65 
 
 
383 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  37.43 
 
 
383 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  37.43 
 
 
383 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  37.43 
 
 
383 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  37.43 
 
 
383 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  43.55 
 
 
321 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  37.17 
 
 
383 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  36.53 
 
 
386 aa  256  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.85 
 
 
372 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.57 
 
 
372 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 
389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
426 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  36.56 
 
 
420 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  37.31 
 
 
420 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 
426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  36.86 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 
430 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 
434 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
432 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
435 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
435 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 
413 aa  162  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
456 aa  159  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
456 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
459 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  28.62 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  28.62 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
412 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  29.69 
 
 
460 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  29.69 
 
 
460 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  27.65 
 
 
520 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
415 aa  100  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
494 aa  97.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
860 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
363 aa  90.5  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7046  putative glycosyltransferase  25 
 
 
473 aa  90.1  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.378884  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  27.95 
 
 
859 aa  90.1  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0744  glycosyl transferase group 1  22.06 
 
 
1666 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  30.97 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
380 aa  89  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  28.19 
 
 
375 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
967 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
489 aa  87.4  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.75 
 
 
375 aa  87  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 
444 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  28.64 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  30.53 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  30.53 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  30.53 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
784 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0277  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
503 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  21.97 
 
 
449 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
773 aa  80.5  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  25.79 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
838 aa  80.1  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6405  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  31.49 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
378 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  31.49 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
384 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  35.46 
 
 
375 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.45 
 
 
815 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  34.75 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 
817 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  22.63 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.44 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  50.77 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>