More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4017 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 784 aa  1576    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  42.65 
 
 		 817 aa  548  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 		 773 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  37.29 
 
 		 494 aa  193  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  36.49 
 
 		 444 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  35.5 
 
 		 441 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  31.53 
 
 		 520 aa  149  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  35.5 
 
 		 449 aa  148  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3833  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00330118  normal  0.252696 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0744  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 		 1666 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 489 aa  119  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2029  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 282 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758751 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 388 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 430 aa  106  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 		 400 aa  106  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 456 aa  105  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 456 aa  105  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 412 aa  103  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 		 384 aa  102  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 382 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 435 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 437 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 408 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 		 420 aa  99  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 		 426 aa  99  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  28.23 
 
 		 383 aa  98.6  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  25.92 
 
 		 386 aa  98.6  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 		 420 aa  98.2  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  23.95 
 
 		 383 aa  97.8  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 423 aa  97.8  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 459 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 382 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 		 384 aa  97.4  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 		 417 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 		 370 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  23.7 
 
 		 383 aa  96.3  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 		 434 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 389 aa  96.3  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  23.7 
 
 		 383 aa  96.3  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  23.7 
 
 		 383 aa  96.3  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 389 aa  96.3  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 399 aa  96.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  23.7 
 
 		 383 aa  96.3  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.42 
 
 		 372 aa  93.6  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.42 
 
 		 372 aa  93.6  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 		 371 aa  94  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 432 aa  92  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 384 aa  92.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 378 aa  91.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 		 381 aa  91.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 		 377 aa  91.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  29.63 
 
 		 460 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  25.94 
 
 		 384 aa  90.1  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 428 aa  90.5  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 		 321 aa  90.5  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 383 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 		 373 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 426 aa  89.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 		 370 aa  89.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  28.67 
 
 		 460 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 		 381 aa  89.7  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 		 471 aa  89  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 		 434 aa  89  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 378 aa  89  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 367 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 455 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 967 aa  87.8  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 346 aa  87.4  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  29.25 
 
 		 346 aa  87.4  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 360 aa  87.4  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  25 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  30.88 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 		 535 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  24.91 
 
 		 417 aa  84  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 397 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 426 aa  84  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  29.44 
 
 		 430 aa  83.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  32.09 
 
 		 379 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 415 aa  83.2  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 382 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 413 aa  80.1  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  25.85 
 
 		 381 aa  80.9  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 1770 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 377 aa  80.1  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3258  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.151939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>