More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3258 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3258  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
391 aa  788    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.151939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6299  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
385 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2371  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0291756  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
393 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
378 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
355 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
382 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 
394 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
360 aa  97.1  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
359 aa  96.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
850 aa  96.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
392 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 
389 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.08 
 
 
351 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
382 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0340  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 
366 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0102921  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
384 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  27.27 
 
 
336 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
368 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
384 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
369 aa  87  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  27.94 
 
 
353 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
381 aa  87  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
369 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 
378 aa  86.3  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
361 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  35.6 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 
416 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2683  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  30.59 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
382 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 
366 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
358 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
382 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
846 aa  83.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.7 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5397  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  27.16 
 
 
2490 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  22.39 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
386 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  32.24 
 
 
846 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
375 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  34.36 
 
 
1770 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.59 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25.27 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.51 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 
784 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
431 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  35.21 
 
 
1232 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  32.42 
 
 
859 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
860 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
1243 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.41 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  30.31 
 
 
520 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  21.84 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 
609 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 
380 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0349  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
1043 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0126249  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.26 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.26 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.26 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.26 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>