More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5397 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5397  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
391 aa  779    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0061  glycosyl transferase group 1  82.1 
 
 
391 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.125882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0249  glycosyl transferase group 1  83.51 
 
 
404 aa  554  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.673407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3078  glycosyl transferase group 1  65.17 
 
 
408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  54.67 
 
 
381 aa  378  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  52.42 
 
 
377 aa  362  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  49.36 
 
 
422 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  47.62 
 
 
389 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  48.05 
 
 
400 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0060  glycosyltransferase  88.02 
 
 
174 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.16157 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4565  glycosyl transferase group 1  43.62 
 
 
390 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2623  glycosyl transferase group 1  45.38 
 
 
391 aa  275  8e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2055  glycosyl transferase group 1  38.4 
 
 
370 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.214984  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4687  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 
367 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6665  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 
433 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1218  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  37.11 
 
 
1089 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  42.05 
 
 
366 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  39.58 
 
 
609 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  38.54 
 
 
1915 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  34.81 
 
 
375 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  39.11 
 
 
385 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 
1241 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  34.25 
 
 
375 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  35.79 
 
 
394 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
420 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  39.6 
 
 
846 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  31.94 
 
 
351 aa  99.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 
417 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  37.63 
 
 
386 aa  99.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
395 aa  99  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  38.73 
 
 
397 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  36.48 
 
 
364 aa  97.4  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  35.92 
 
 
370 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  38.61 
 
 
846 aa  96.7  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
369 aa  96.7  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  36.68 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 
408 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
382 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 
370 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  36.15 
 
 
382 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  36.65 
 
 
1398 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
1028 aa  90.1  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
384 aa  90.1  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.13 
 
 
361 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 
831 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  36.13 
 
 
361 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
384 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
1261 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.39 
 
 
414 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.39 
 
 
414 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.39 
 
 
414 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.39 
 
 
414 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.39 
 
 
401 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 
838 aa  88.6  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  33.84 
 
 
1243 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 
1241 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
398 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  27.09 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  27.36 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
387 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0939  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
381 aa  87  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872922  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
435 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
371 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  26.96 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
434 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 
1229 aa  86.3  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.19 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
434 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  26.09 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  30.91 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.31 
 
 
379 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
392 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  31.09 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
376 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.48 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3258  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.151939 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  35.91 
 
 
859 aa  82.8  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
380 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>