More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6299 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6299  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
385 aa  802    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2371  glycosyl transferase group 1  56.49 
 
 
395 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0291756  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3258  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
391 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.151939 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
395 aa  110  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
386 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
400 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.47 
 
 
351 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
369 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
376 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
381 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 
1241 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
1739 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2683  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
390 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
374 aa  93.2  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
381 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
378 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  36.4 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
393 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
437 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  27.01 
 
 
374 aa  89.7  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.59 
 
 
361 aa  89.7  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
385 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
408 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
394 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
1089 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
609 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
1241 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
1915 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2280  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
367 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00320483  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  32.93 
 
 
336 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  35.9 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
374 aa  86.7  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
420 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  29.11 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  37.66 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2932  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3164  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
442 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
384 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
360 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  44.64 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 
1229 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  28.39 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
1770 aa  80.9  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  43.56 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.91 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3042  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  27.35 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1250  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  27.35 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157678  hitchhiker  0.000000000000131869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
1398 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  29.21 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
1028 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  40.54 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.83 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.16 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
850 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
846 aa  77.4  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  27.8 
 
 
859 aa  77  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4068  group 1 glycosyl transferase  26.73 
 
 
501 aa  77  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.736051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
371 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
860 aa  77  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  42.16 
 
 
1261 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  28.46 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  27.8 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  31.61 
 
 
846 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  39.66 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  40.86 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>