More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3832 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 426 aa  876    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 		 366 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.14 
 
 		 364 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.07 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  29.82 
 
 		 520 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.29 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  29.29 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.29 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.29 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.29 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.29 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.29 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  31 
 
 		 361 aa  97.1  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 434 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 377 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  24.31 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 366 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 366 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 378 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 860 aa  94.7  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  29.14 
 
 		 859 aa  94.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 420 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 388 aa  92.8  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.48 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  28.24 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  26.81 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 370 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  28.84 
 
 		 364 aa  90.5  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  29.49 
 
 		 384 aa  90.1  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 375 aa  90.5  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 381 aa  90.5  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 357 aa  90.1  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 373 aa  89.7  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 		 1243 aa  89.7  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 489 aa  89.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  28.96 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2280  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00320483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 378 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 378 aa  88.2  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 494 aa  87.8  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 371 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 417 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2029  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 		 282 aa  87  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 370 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 364 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 361 aa  86.7  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 399 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  27.37 
 
 		 353 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 838 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 850 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  25.83 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  26.01 
 
 		 1219 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  26.15 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 817 aa  83.2  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  25.81 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.21 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3290  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>