More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2434 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
426 aa  837    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  60.19 
 
 
432 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  62.12 
 
 
456 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  62.12 
 
 
456 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  58.55 
 
 
435 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  58.55 
 
 
435 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  61.54 
 
 
459 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  60.19 
 
 
434 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  42.29 
 
 
430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  39.39 
 
 
383 aa  249  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  37.38 
 
 
388 aa  245  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  37.85 
 
 
383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  37.85 
 
 
383 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  37.85 
 
 
383 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  37.85 
 
 
383 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  37.85 
 
 
383 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  37.12 
 
 
383 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  38.52 
 
 
384 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  37.85 
 
 
399 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.12 
 
 
372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.12 
 
 
372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  44.71 
 
 
321 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  37.02 
 
 
386 aa  224  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 
420 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 
420 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  44.01 
 
 
423 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  33.56 
 
 
426 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  33.33 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  35.61 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  25.24 
 
 
447 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  30.66 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 
415 aa  126  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  33.46 
 
 
494 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
817 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  31.11 
 
 
460 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
441 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 
784 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
449 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  30.31 
 
 
1635 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  30.8 
 
 
460 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
444 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
455 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
838 aa  95.5  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  28.52 
 
 
520 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
860 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  34.58 
 
 
859 aa  93.6  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
1243 aa  93.2  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
1241 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
380 aa  92  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  29.79 
 
 
846 aa  92  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
846 aa  92  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 
967 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  30.69 
 
 
431 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.06 
 
 
815 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
831 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
1241 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 
390 aa  87  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
773 aa  86.7  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
1229 aa  84.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
850 aa  84  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
1261 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
1398 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0354  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2181  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.38 
 
 
507 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2303  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.38 
 
 
507 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500428  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1074  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.38 
 
 
507 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109997  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0525  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.38 
 
 
507 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.317265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3285  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.38 
 
 
507 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3298  WcbE  34.38 
 
 
507 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00149764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3250  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.38 
 
 
507 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  43.36 
 
 
489 aa  77.8  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  38.17 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  31.08 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
433 aa  76.6  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2029  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0758751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>