More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1162 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 384 aa  780    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  62.92 
 
 		 383 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  62.4 
 
 		 383 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  62.4 
 
 		 383 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  62.4 
 
 		 383 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  62.4 
 
 		 383 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  62.5 
 
 		 383 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  62.2 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  62.63 
 
 		 372 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  62.37 
 
 		 372 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  60.1 
 
 		 383 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  66.02 
 
 		 321 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  51.31 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  50.13 
 
 		 386 aa  362  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  41.16 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  40.05 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  41.58 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  41.58 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  42.93 
 
 		 426 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  43.8 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  40.42 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  42.04 
 
 		 423 aa  246  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  39.3 
 
 		 459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  39.95 
 
 		 456 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  40.25 
 
 		 420 aa  239  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  38.82 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  38.92 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  42.51 
 
 		 413 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  42.03 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  36.24 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  36.24 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 		 430 aa  209  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  29.68 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  32.45 
 
 		 412 aa  149  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 412 aa  136  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  33.75 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  28.26 
 
 		 520 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  33.75 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 		 967 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 494 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  30.47 
 
 		 859 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 860 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 		 773 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  31.72 
 
 		 375 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.67 
 
 		 815 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 441 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 1261 aa  95.9  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  30.94 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 1398 aa  93.2  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  31.09 
 
 		 1635 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 1241 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  27.15 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 		 784 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 850 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 1243 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 817 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 		 449 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 437 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  21.2 
 
 		 420 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 384 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.51 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7046  putative glycosyltransferase  29.87 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.378884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0277  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 846 aa  84.3  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  26.92 
 
 		 846 aa  84  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0744  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 1666 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 1229 aa  83.2  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  36.64 
 
 		 1241 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 		 838 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  25.83 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  25.83 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 		 831 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3833  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00330118  normal  0.252696 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  25.61 
 
 		 743 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>