More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3578 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  100 
 
 		 412 aa  827    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  36.27 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  39.33 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 435 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 435 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 434 aa  156  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  40.35 
 
 		 413 aa  143  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 426 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 		 420 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  36.23 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  32.68 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 420 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  30.51 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  30.27 
 
 		 383 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  30.27 
 
 		 383 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  30.27 
 
 		 383 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  30.27 
 
 		 383 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 		 423 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.71 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.87 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  28.62 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 417 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  28.57 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  30.58 
 
 		 859 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  36.75 
 
 		 382 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  32.13 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 860 aa  96.3  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  23.54 
 
 		 447 aa  95.5  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  40.61 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  35.66 
 
 		 471 aa  94  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 431 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 377 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 376 aa  92.8  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  31.35 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 		 376 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  31.35 
 
 		 375 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0743  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 		 354 aa  89.4  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0554251  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  26.92 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  34.36 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  31.1 
 
 		 361 aa  88.2  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 		 371 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0354  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 343 aa  87.4  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  26.5 
 
 		 353 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 		 443 aa  86.3  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  26.5 
 
 		 353 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 376 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  37.22 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  25.21 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  27.78 
 
 		 520 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  29.87 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  35.63 
 
 		 363 aa  82.8  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1976  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 541 aa  81.6  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0537449  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 		 672 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  27.72 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4202  glycosyl transferase group 1  41.06 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730151  normal  0.251935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  33.99 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>