More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8689 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
435 aa  857    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
435 aa  857    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  78.67 
 
 
432 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  78.69 
 
 
434 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  60.96 
 
 
456 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  60.96 
 
 
456 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  61.15 
 
 
459 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  59.48 
 
 
426 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  41.12 
 
 
430 aa  298  9e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  37.03 
 
 
386 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  36.64 
 
 
388 aa  236  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  34.61 
 
 
383 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  37.91 
 
 
420 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 
384 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  36.73 
 
 
383 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  34.05 
 
 
383 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  34.05 
 
 
383 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  34.05 
 
 
383 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  34.05 
 
 
383 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  35 
 
 
383 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 
399 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  37.56 
 
 
420 aa  203  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.49 
 
 
372 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  38.92 
 
 
321 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.49 
 
 
372 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  40.55 
 
 
423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 
426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  43.1 
 
 
413 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  31.85 
 
 
417 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3578  glycosyl transferase  31.46 
 
 
412 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.643047  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3018  hypothetical protein  33.46 
 
 
384 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  25.59 
 
 
447 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 
412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 
415 aa  113  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.72 
 
 
815 aa  102  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
1241 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
494 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
455 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
838 aa  95.5  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
420 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
860 aa  90.9  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  31.43 
 
 
859 aa  90.5  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  28.46 
 
 
460 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  31.84 
 
 
1635 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
435 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
1241 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  28.45 
 
 
460 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 
434 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  29.55 
 
 
431 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
1243 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1976  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
541 aa  84.7  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0537449  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
846 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  28.69 
 
 
846 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
850 aa  80.9  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
831 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 
1229 aa  80.1  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
1261 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
817 aa  80.1  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  38.96 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0750  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
773 aa  76.6  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  30.15 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3298  WcbE  29.38 
 
 
507 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00149764  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3285  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.38 
 
 
507 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3250  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.38 
 
 
507 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2303  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.04 
 
 
507 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500428  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2181  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.04 
 
 
507 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1074  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.04 
 
 
507 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0525  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.04 
 
 
507 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.317265  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  29.5 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4017  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
784 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.997952  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
1398 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
967 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>