More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6405 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6405  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
384 aa  793    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0893  glycosyl transferase, group 1  36.15 
 
 
389 aa  249  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.021774  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
375 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
378 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
361 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  30.92 
 
 
353 aa  89.7  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
355 aa  86.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7046  putative glycosyltransferase  28.7 
 
 
473 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.378884  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
354 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
364 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0510  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3839  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.24097  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  29.02 
 
 
859 aa  80.5  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
860 aa  80.5  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0415  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  28.19 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  31.86 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
360 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  26.59 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  25.56 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  25.86 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0427  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0724204  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  31.4 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  31.86 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  31.86 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
370 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1649  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
449 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0395854  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1310  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.731702  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1327  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1346  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
850 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  26.37 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0744  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
1666 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4470  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3768  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01924  hypothetical protein  25.6 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01937  putative glycosyltransferase WbbC  25.6 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  27.11 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
1241 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
370 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1042  putative glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
375 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1397  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  28.4 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  25.09 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3290  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  25.09 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
535 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  22.53 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  22.53 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  25 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  27.93 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
361 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  24.71 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
967 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  27.56 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>