More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2616 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3008  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 524 aa  1073    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2616  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 524 aa  1073    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2303  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.41 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3298  WcbE  42.41 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00149764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1074  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.41 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2181  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.41 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3285  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.41 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3250  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.41 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0525  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.41 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.317265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2595  hypothetical protein  74.19 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2980  hypothetical protein  74.19 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0277  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 503 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 		 381 aa  96.3  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 		 377 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  25.4 
 
 		 430 aa  90.1  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 		 428 aa  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 400 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 443 aa  87  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  37.28 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 		 420 aa  83.2  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 		 417 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 1243 aa  82.8  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  36.69 
 
 		 460 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 		 1241 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  37.41 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25.18 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  37.33 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  22.41 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.18 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  38.41 
 
 		 1635 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 459 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 355 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  35.39 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1887  mannosyltransferase  26.07 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  27.79 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0744  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 1666 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1232 aa  74.7  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  39.26 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1397  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 368 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  36.88 
 
 		 390 aa  73.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 		 380 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 		 1241 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0232  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 		 340 aa  72.8  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 		 838 aa  72  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  40.32 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.14 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  37.59 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  29.07 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 		 831 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 		 1398 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 382 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 364 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 		 1229 aa  69.3  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  28.31 
 
 		 374 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7046  putative glycosyltransferase  27.3 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.378884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  25.84 
 
 		 846 aa  68.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 		 1261 aa  68.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  36.64 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>