216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2582 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 1332 aa  2758    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  99.55 
 
 		 1915 aa  2689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  46.79 
 
 		 1241 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  45.8 
 
 		 1241 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  44.72 
 
 		 1261 aa  535  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  39.59 
 
 		 1398 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  43.49 
 
 		 1243 aa  478  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 		 1229 aa  380  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  42.19 
 
 		 1089 aa  310  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  40.79 
 
 		 1028 aa  266  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 846 aa  229  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  36.76 
 
 		 831 aa  228  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  36.43 
 
 		 838 aa  228  7e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  31.99 
 
 		 1635 aa  228  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  29.67 
 
 		 846 aa  227  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 850 aa  214  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  25.4 
 
 		 743 aa  196  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 860 aa  195  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  33.5 
 
 		 859 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.77 
 
 		 815 aa  186  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  32.99 
 
 		 431 aa  180  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 		 967 aa  169  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  35.04 
 
 		 460 aa  136  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 		 455 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  34.25 
 
 		 460 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 		 384 aa  99.8  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2583  hypothetical protein  26.67 
 
 		 549 aa  98.6  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2968  hypothetical protein  26.67 
 
 		 523 aa  98.2  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 		 437 aa  81.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1976  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 541 aa  75.5  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0537449  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 434 aa  73.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1346  hypothetical protein  32.39 
 
 		 681 aa  71.6  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  26.19 
 
 		 383 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 		 355 aa  70.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 		 384 aa  69.7  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 		 482 aa  67.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 435 aa  67.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 382 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 		 412 aa  66.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4011  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0191  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 779 aa  65.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 459 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 456 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 456 aa  64.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 		 423 aa  63.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 435 aa  62  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 435 aa  62  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 389 aa  62  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 399 aa  62  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 389 aa  62  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  20.86 
 
 		 520 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  25.21 
 
 		 383 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  25.21 
 
 		 383 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 381 aa  60.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  25.21 
 
 		 383 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  25.21 
 
 		 383 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.21 
 
 		 372 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.21 
 
 		 372 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  25.21 
 
 		 383 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7046  putative glycosyltransferase  28.14 
 
 		 473 aa  57.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.378884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 395 aa  58.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 381 aa  57  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3020  hypothetical protein  22.19 
 
 		 417 aa  57  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 		 433 aa  57  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 387 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 354 aa  56.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 387 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 471 aa  56.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 382 aa  56.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1261  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 402 aa  56.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 435 aa  55.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  22.34 
 
 		 372 aa  55.8  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2683  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 390 aa  55.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 366 aa  55.5  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0106  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 469 aa  55.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.341014  normal  0.913948 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 363 aa  55.5  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 		 380 aa  55.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 420 aa  55.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2724  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 430 aa  55.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5391  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 375 aa  54.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.919124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3194  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 362 aa  54.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 358 aa  53.5  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2616  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 524 aa  53.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3008  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 524 aa  53.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 		 426 aa  53.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 343 aa  53.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4007  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 388 aa  53.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0399427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>